器质性勃起功能障碍包括各种先天性和后天性疾病引起勃起功能障碍。

引起勃起功能障碍的勃起器官疾病先天性畸形：尿道下裂、尿道上裂、先天性痛性阴茎勃起、小阴茎畸形；机械性因素：病理性肥胖、纤维性海绵体炎、双侧阴囊水肿、包茎、包皮系带过短、阴茎肿瘤；代谢性紊乱：糖尿病、血色素沉着症、酗酒、肝广肾功能不全、镰状细胞病、硬皮病、甲状腺疾患、肾上腺疾患；神经性疾患：多系统萎缩、脊髓损伤、多发性硬化、脊髓痨、外周神经疾病、脊柱裂、侧索硬化、性肌萎缩等。手术因素：膀胱切除术、尿道切除术、前列腺切除术、腹会阴联合直肠切除术、前低位直肠切除术、直肠全切术、经尿道前列腺电切术、外扩约肌切开术；原发性性腺功能异常：染色体异常(即克莱恩费尔特氏综合征)、双侧无睾症、性腺毒素、药物性性腺损害(化疗药)、性腺损伤(创伤／流行性腮腺炎／睾丸扭转)等。